Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SORCS3Q9UPU3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SORCS3Q9UPU3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms