Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PACSIN2Q9UNF0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PACSIN2Q9UNF0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms