Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHA12Q9UN75 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHA12Q9UN75 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms