Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNRF3Q9ULT6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms