Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRID1Q9ULK0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms