Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB23Q9ULC3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms