Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDAC9Q9UKV0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC9Q9UKV0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms