Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RCAN3Q9UKA8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCAN3Q9UKA8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms