Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GGA1Q9UJY5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA1Q9UJY5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms