Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC23Q9UJX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms