Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIMS3Q9UJD0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms