Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN11AQ9UI33 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN11AQ9UI33 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms