Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD8

SEPT9, Septin-9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT9Q9UHD8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEPT9Q9UHD8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEPT9Q9UHD8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms