Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
IFT172Q9UG01 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms