Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MGAT4CQ9UBM8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MGAT4CQ9UBM8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms