Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RNF7Q9UBF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms