Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAGEC2Q9UBF1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEC2Q9UBF1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms