Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUCLA2Q9P2R7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms