Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP35Q9P2H5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
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