Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CCDC180Q9P1Z9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CCDC180Q9P1Z9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms