Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABRACLQ9P1F3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms