Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SCHIP1Q9P0W5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms