Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HACD3Q9P035 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD3Q9P035 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD3Q9P035 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD3Q9P035 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HACD3Q9P035 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD3Q9P035 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HACD3Q9P035 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms