Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CWC15Q9P013 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms