Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EHD3Q9NZN3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EHD3Q9NZN3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms