Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKIRAS1Q9NYS0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms