Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DLL3Q9NYJ7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms