Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHBDL2Q9NX52 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHBDL2Q9NX52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHBDL2Q9NX52 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHBDL2Q9NX52 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHBDL2Q9NX52 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDL2Q9NX52 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms