Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMBRD1Q9NUN5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms