Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHDC1Q9NTX5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ECHDC1Q9NTX5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms