Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJB4Q9NTQ9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJB4Q9NTQ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms