Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3GQ9NS98 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms