Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNNM1Q9NRU3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms