Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDHAF3Q9NRP4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SDHAF3Q9NRP4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms