Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C8orf17Q9NRJ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms