Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF4Q9NR80 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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