Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AKIP1Q9NQ31 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AKIP1Q9NQ31 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms