Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8P0

SRD5A3, Polyprenol reductase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRD5A3Q9H8P0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRD5A3Q9H8P0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRD5A3Q9H8P0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRD5A3Q9H8P0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRD5A3Q9H8P0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms