Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTNAP4Q9C0A0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTNAP4Q9C0A0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms