Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INO80BQ9C086 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
INO80BQ9C086 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms