Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms