Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLRP1Q9C000 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NLRP1Q9C000 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms