Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFIH1Q9BYX4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFIH1Q9BYX4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms