Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM55Q9BYV6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM55Q9BYV6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms