Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP2-4Q9BYR9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms