Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HIGD2AQ9BW72 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms