Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NUP58Q9BVL2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP58Q9BVL2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms