Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS4Q9BT78 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms