Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSEN34Q9BSV6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms