Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TM2D3Q9BRN9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TM2D3Q9BRN9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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